A településtől északra terül el a Zempléni-hegység, ami a belső kárpáti vulkáni övezet része. A világhírnévnek örvendő tokaji szőlő (bor) legfőképpen a vulkanikus eredetű talajnak köszönheti különleges és egyedülálló minőségét. Bodrogkisfalud határában riolit, andezit, piroxéndacit málladékokon, illetve lejtőüledékeken képződött talajokon folyik a szőlő termesztése. A talaj kémhatása gyengén savanyú vagy semleges, vízgazdálkodása kedvező, vízáteresztő képessége közepes, víztartó képessége jó. A faluhoz legközelebb a 475 méter magas Cigány-hegy (kb. 10 millió éves), valamint 5 kilométerre a Tokaji-hegy található. A Bodrogzug - melyet a Tisza, Bodrog és a Török-ér határol - délről és keletről érinti a települést. E vidék a XIX. századi folyószabályozás előtt túlnyomórészt vízzel borított, mocsaras terület volt, ma rendkívül gazdag a növény és állatvilága.